Sau khi được phê duyệt, tổng mức đầu tư của dự án giảm 118.037 tỷ đồng so với phương án ban đầu, đồng thời loại 3 phường Vĩnh Tuy, Vĩnh Hưng và Hoàng Mai khỏi phạm vi dự án như trong nghị quyết sơ bộ.